La UCA forma parte de las redes y asociaciones internacionales detalladas en los siguientes enlaces:
Asociación Universitaria Iberoamericana de Postgrado (AUIP)
Coalición Centroamericana de Prevención de Violencia (CCPVJ)
Consejo Latinoamericano de Ciencias Sociales (CLACSO)
Cristianos por la Paz (CRISPAZ) 
Organización Universitaria Interamericana (OUI-IOHE) 
Plataforma de Seguridad Juvenil de Centroamérica (PSJ) 
Red Jesuita con Migrantes Centroamérica (RJM)